J'ai corné la page pour marquer ou en suis-je
"ou en suis-je" n'est pas correct, il faut dire "où j'en [suis/étais]"
Dire "où j'en étais" sous entend que vous vous êtes arrêté(e) de lire, on marque l’arrêt de l'action.
Dire "où j'en suis" sous-entend que vous n'avez pas fini de lire le livre, donc que vous êtes encore dans l'histoire du livre. Ceci sera donc plus utilisé si vous êtes passionné(e) par cette lecture.
Les deux sont corrects.
J'ai corné la page pour marquer d'où il me faut reprendre plus tard
La phrase est correcte, mais grammaticalement très lourde, une formulation plus légère pourrait être (merci JeromeJ):
J'ai corné la page pour marquer où reprendre plus tard
J'ai corné la page pour marquer les pages que j'ai lues
La phrase est correcte, mais le sens n'est pas le même. On pourrait comprendre que vous avez corné CHAQUE page lue, et non uniquement la dernière.
Conclusion
La formulation la plus naturelle est donc la première, à savoir :
J'ai corné la page pour marquer où j'en [suis/étais]