Yes, les premiers and en premier are synonymous here.
Note that there is quite a lot of flexibility about the word ordering here:
Qui plus est, ce sont eux qui ont violé le traité les premiers !
Qui plus est, ce sont eux qui ont, les premiers, violé le traité !
Qui plus est, ce sont eux qui, les premiers, ont violé le traité !
Qui plus est, ce sont eux les premiers qui ont violé le traité !
Qui plus est, ce sont les premiers qui ont violé le traité, eux !
Qui plus est, les premiers qui ont violé le traité, ce sont eux !
Note also that eux and les premiers must agree in gender and number while en premier as an adverbial phrase stays invariable:
Qui plus est, ce sont elles qui ont violé le traité les premières !
Qui plus est, c'est lui qui a violé le traité le premier !