TL;DR: dans une question, lorsque « qui » est le sujet, « qui » est considéré comme singulier et le verbe s'accorde en conséquence. Les questions commençant par « Qui sont ... » existent mais alors « qui » n'est pas le sujet.
Je ne suis pas d'accord avec la réponse de Vince qui est actuellement acceptée. En particulier avec la phrase conclusive « When one knows that the subject is plural, one uses the plural form. »
En français, lorsque « qui » représente le sujet, « qui » est considéré comme singulier, même lorsque l'on sait pertinemment que plusieurs personnes sont concernées par la question. Par exemple, à l'affirmation « Il y a trois personnes qui ne peuvent pas entrer », on ne demandera pas « Qui ne peuvent pas entrer ? » mais « Qui ne peut pas entrer ? ».
Il faut comprendre que dans une question qui commence par « qui », ce « qui » peut représenter plusieurs choses :
soit le sujet : « Qui monte dans ma voiture ? ». Dans ce cas on peut toujours remplacer « qui » par « qui est-ce qui » (ou, plus populairement « qui c'est qui »). Si ce remplacement n'est pas possible, alors c'est que « qui » n'est pas le sujet. Comme dit plus haut, qui est alors singulier et le verbe s'accorde avec lui (à la 3ème personne du singulier donc).
soit le complément d'objet : « Qui déposons-nous à la gare ? ». Dans ce cas on peut soit remplacer « qui » par « qui est-ce que » (ou, plus populairement « qui c'est que »), soit en inversant les mots : « Nous déposons qui à la gare ? ». Si ce remplacement ou cette inversion ne sont pas possibles, alors c'est que « qui » n'est pas le complément d'objet. Le verbe s'accorde avec le sujet et il est donc au pluriel dans cet exemple puisque le sujet est « nous ».
À noter que « Qui aide Jeanne ? » est ambigu en l'absence de contexte : on ne sait pas si quelqu'un aide Jeanne (« Qui est-ce qui aide Jeanne ? ») ou si Jeanne aide quelqu'un (« Qui Jeanne aide-t-elle ? », « Jeanne aide qui ? »).
En revanche, « Qui acclament ces gens ? » n'est pas ambigu à l'écrit car du fait du pluriel, « qui » n'est pas le sujet. Mais c'est ambigu à l'oral et l'on dira plutôt « Qui est-ce que ces gens acclament ? » ou « Ces gens acclament qui ? » ou, plus soutenu, « Qui ces gens acclament-ils ? »
soit l'attribut, et on en revient à votre question : dans « Qui sont vos meilleurs amis ? », « qui » n'est pas sujet de « sont » mais est l'attribut du sujet qui est en réalité "vos meilleurs amis". Ça devient évident lorsque l'on passe au régime soutenu et que l'on tourne la question ainsi : « Qui vos meilleurs amis sont-ils ? » ou si l'on remplace « Qui » par « Où » (« Où sont vos meilleurs amis ? »). Le verbe s'accorde bien sûr avec le sujet qui est ici un pluriel.
À noter que dans une question qui commence par « qui est », « qui » n'est pas toujours un attribut, ce peut être le sujet comme par exemple dans « Qui est d'accord ? » ou « Qui est en train de faire du bruit ? ». Dans ce cas bien sûr le verbe est à la 3ème personne du singulier. Si « qui » est un attribut, on doit pouvoir le remplacer par « quel » (à accorder au besoin) qui va rendre la question plus soutenue : « Quels sont vos meilleurs amis ? », « Quelle est cette personne ? ». Si ce remplacement n'est pas possible, alors c'est que « qui » n'est pas un attribut.
Pour conclure, je vais répondre à votre question : on peut commencer une question par « Qui sont ... » mais dans ce cas « qui » n'est pas le sujet de « sont ».
