C'est une très bonne question qui trouve une réponse facile :
Il ne s'agit que de typographie. Et, en matière de typographie, il n'est que des usages.
Usage venu de l'habitude de commencer par une lettre capitale une ligne de texte écrite après un passage à la ligne + saut de ligne. (cf poésies)
On notera un fait curieux, Grevisse, grand observateur des usages de la langue va noter, dans sa 13e édition (§ 97, 2°) "on doit mettre une majuscule à cette lettre initiale, malgré la virgule qui la précède." Il était moins catégorique dans sa 12e édition qui fait disparaître ce doit : "on met la majuscule à cette lettre initiale"...
aMuSAnt noN ?
On notera qu'il en va de même dans les livres lorsque les titres de chapitre commencent une phrase qui va se poursuivre ensuite à la ligne. Beaucoup d'auteurs / éditeurs commenceront la suite par un retrait et une majuscule. Mais... certains (cf Le Clézio / Gallimard) débuteront la suite avec une minuscule sans retrait.
Pour ce qui me concerne, je crois la casse de cette première lettre du texte après l'appel lié au retrait de première ligne. Tu fais un retrait de première ligne => Capitale. Tu n'en fais pas -> bas de casse.